Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Saa4P31532 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms