Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnd3P30282 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnd3P30282 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd3P30282 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnd3P30282 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnd3P30282 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnd3P30282 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnd3P30282 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms