Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pabpc1P29341 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc1P29341 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms