Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mep1aP28825 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mep1aP28825 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms