Protein–RNA interactions for Protein: P28740

Kif2a, Kinesin-like protein KIF2A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif2aP28740 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif2aP28740 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Kif2aP28740 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif2aP28740 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kif2aP28740 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif2aP28740 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif2aP28740 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif2aP28740 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif2aP28740 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif2aP28740 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif2aP28740 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif2aP28740 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif2aP28740 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif2aP28740 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif2aP28740 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif2aP28740 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif2aP28740 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif2aP28740 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif2aP28740 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kif2aP28740 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif2aP28740 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif2aP28740 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif2aP28740 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif2aP28740 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif2aP28740 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif2aP28740 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kif2aP28740 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif2aP28740 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif2aP28740 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif2aP28740 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif2aP28740 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif2aP28740 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif2aP28740 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif2aP28740 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif2aP28740 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kif2aP28740 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kif2aP28740 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kif2aP28740 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif2aP28740 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif2aP28740 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif2aP28740 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Kif2aP28740 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kif2aP28740 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif2aP28740 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms