Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjc1P28229 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjc1P28229 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjc1P28229 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms