Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lef1P27782 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lef1P27782 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lef1P27782 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lef1P27782 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms