Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrcc6P23475 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms