Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb4P21440 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms