Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms