Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl13aP19253 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl13aP19253 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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