Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csn1s1P19228 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csn1s1P19228 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms