Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna9P09235 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms