Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col4a1P02463 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a1P02463 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Col4a1P02463 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms