Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01821 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P01821 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01821 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01821 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01821 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01821 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01821 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01821 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01821 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01821 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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P01821 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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P01821 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01821 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01821 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01821 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms