Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01735 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01735 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01735 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01735 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01735 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01735 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01735 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01735 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01735 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01735 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01735 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01735 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01735 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01735 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01735 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01735 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01735 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01735 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01735 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01735 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01735 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01735 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01735 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01735 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01735 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01735 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01735 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01735 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01735 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01735 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01735 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01735 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01735 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01735 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01735 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01735 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01735 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01735 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01735 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms