Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01658 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01658 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01658 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01658 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01658 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01658 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01658 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01658 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01658 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01658 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01658 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01658 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01658 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01658 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01658 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01658 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01658 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01658 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01658 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01658 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01658 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01658 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01658 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01658 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01658 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01658 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01658 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01658 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01658 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01658 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01658 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01658 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01658 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01658 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01658 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01658 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01658 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01658 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01658 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01658 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01658 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01658 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01658 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01658 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01658 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01658 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01658 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01658 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01658 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01658 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01658 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01658 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01658 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01658 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01658 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms