Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01638 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01638 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01638 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01638 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01638 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01638 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01638 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01638 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01638 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01638 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01638 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01638 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01638 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01638 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01638 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01638 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01638 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01638 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01638 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01638 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01638 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01638 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01638 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01638 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01638 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01638 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01638 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01638 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01638 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01638 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01638 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01638 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01638 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01638 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01638 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01638 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01638 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01638 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01638 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01638 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01638 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01638 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01638 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P01638 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01638 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P01638 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01638 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01638 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01638 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01638 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01638 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P01638 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01638 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01638 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01638 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01638 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01638 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms