Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mtatp6P00848 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms