Protein–RNA interactions for Protein: P00397

Mtco1, Cytochrome c oxidase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco1P00397 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtco1P00397 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtco1P00397 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtco1P00397 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtco1P00397 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtco1P00397 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtco1P00397 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtco1P00397 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtco1P00397 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mtco1P00397 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mtco1P00397 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtco1P00397 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms