Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ntsr1O88319 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ntsr1O88319 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms