Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lnx1O70263 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lnx1O70263 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms