Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema6bO54951 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema6bO54951 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema6bO54951 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms