Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf12O54907 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms