Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DffaO54786 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DffaO54786 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DffaO54786 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DffaO54786 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DffaO54786 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DffaO54786 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DffaO54786 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DffaO54786 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DffaO54786 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DffaO54786 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DffaO54786 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DffaO54786 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DffaO54786 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DffaO54786 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DffaO54786 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DffaO54786 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DffaO54786 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DffaO54786 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DffaO54786 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DffaO54786 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DffaO54786 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DffaO54786 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DffaO54786 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DffaO54786 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DffaO54786 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DffaO54786 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DffaO54786 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DffaO54786 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DffaO54786 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DffaO54786 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DffaO54786 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DffaO54786 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DffaO54786 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DffaO54786 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DffaO54786 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DffaO54786 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DffaO54786 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DffaO54786 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DffaO54786 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DffaO54786 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DffaO54786 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DffaO54786 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DffaO54786 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DffaO54786 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DffaO54786 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DffaO54786 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DffaO54786 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DffaO54786 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DffaO54786 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DffaO54786 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DffaO54786 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DffaO54786 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DffaO54786 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DffaO54786 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DffaO54786 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DffaO54786 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DffaO54786 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DffaO54786 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DffaO54786 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DffaO54786 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DffaO54786 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DffaO54786 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DffaO54786 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DffaO54786 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DffaO54786 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DffaO54786 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DffaO54786 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DffaO54786 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DffaO54786 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DffaO54786 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DffaO54786 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DffaO54786 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DffaO54786 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DffaO54786 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DffaO54786 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DffaO54786 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DffaO54786 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DffaO54786 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DffaO54786 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DffaO54786 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DffaO54786 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DffaO54786 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DffaO54786 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DffaO54786 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DffaO54786 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DffaO54786 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DffaO54786 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms