Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cavin1O54724 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cavin1O54724 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms