Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per1O35973 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Per1O35973 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per1O35973 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per1O35973 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per1O35973 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per1O35973 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per1O35973 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per1O35973 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Per1O35973 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Per1O35973 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Per1O35973 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Per1O35973 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Per1O35973 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Per1O35973 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Per1O35973 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Per1O35973 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per1O35973 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per1O35973 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per1O35973 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per1O35973 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per1O35973 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per1O35973 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per1O35973 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per1O35973 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per1O35973 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per1O35973 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per1O35973 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per1O35973 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per1O35973 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per1O35973 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Per1O35973 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Per1O35973 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per1O35973 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per1O35973 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per1O35973 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per1O35973 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per1O35973 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per1O35973 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per1O35973 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per1O35973 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Per1O35973 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Per1O35973 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per1O35973 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per1O35973 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per1O35973 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per1O35973 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per1O35973 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per1O35973 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per1O35973 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per1O35973 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per1O35973 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per1O35973 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per1O35973 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per1O35973 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per1O35973 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per1O35973 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per1O35973 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Per1O35973 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms