Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nek2O35942 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek2O35942 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek2O35942 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek2O35942 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek2O35942 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek2O35942 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek2O35942 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nek2O35942 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nek2O35942 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek2O35942 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek2O35942 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nek2O35942 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nek2O35942 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms