Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SpibO35906 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpibO35906 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpibO35906 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpibO35906 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpibO35906 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpibO35906 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpibO35906 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpibO35906 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpibO35906 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpibO35906 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpibO35906 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpibO35906 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpibO35906 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpibO35906 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SpibO35906 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpibO35906 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpibO35906 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SpibO35906 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpibO35906 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpibO35906 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpibO35906 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SpibO35906 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpibO35906 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpibO35906 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpibO35906 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpibO35906 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpibO35906 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpibO35906 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpibO35906 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpibO35906 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpibO35906 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpibO35906 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpibO35906 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpibO35906 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpibO35906 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpibO35906 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpibO35906 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpibO35906 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpibO35906 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SpibO35906 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SpibO35906 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SpibO35906 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpibO35906 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpibO35906 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpibO35906 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpibO35906 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpibO35906 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpibO35906 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpibO35906 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpibO35906 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpibO35906 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpibO35906 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpibO35906 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpibO35906 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpibO35906 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SpibO35906 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpibO35906 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpibO35906 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SpibO35906 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpibO35906 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpibO35906 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpibO35906 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpibO35906 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpibO35906 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpibO35906 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpibO35906 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpibO35906 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpibO35906 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpibO35906 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SpibO35906 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpibO35906 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpibO35906 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpibO35906 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SpibO35906 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpibO35906 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpibO35906 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpibO35906 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SpibO35906 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SpibO35906 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SpibO35906 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms