Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm44O35857 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm44O35857 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm44O35857 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm44O35857 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm44O35857 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm44O35857 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm44O35857 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm44O35857 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timm44O35857 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Timm44O35857 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm44O35857 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms