Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf9O35739 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf9O35739 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf9O35739 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms