Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx1aO35526 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx1aO35526 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms