Protein–RNA interactions for Protein: O35453

Hpn, Serine protease hepsin, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpnO35453 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpnO35453 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpnO35453 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpnO35453 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HpnO35453 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpnO35453 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpnO35453 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpnO35453 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpnO35453 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpnO35453 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpnO35453 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HpnO35453 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HpnO35453 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpnO35453 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpnO35453 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpnO35453 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpnO35453 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpnO35453 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpnO35453 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpnO35453 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpnO35453 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HpnO35453 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpnO35453 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpnO35453 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpnO35453 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HpnO35453 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HpnO35453 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HpnO35453 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HpnO35453 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpnO35453 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpnO35453 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpnO35453 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpnO35453 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpnO35453 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpnO35453 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HpnO35453 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HpnO35453 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HpnO35453 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HpnO35453 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HpnO35453 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HpnO35453 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HpnO35453 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HpnO35453 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HpnO35453 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HpnO35453 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HpnO35453 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HpnO35453 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HpnO35453 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HpnO35453 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HpnO35453 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HpnO35453 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HpnO35453 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HpnO35453 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HpnO35453 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HpnO35453 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HpnO35453 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HpnO35453 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms