Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casq1O09165 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casq1O09165 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casq1O09165 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Casq1O09165 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casq1O09165 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casq1O09165 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casq1O09165 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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