Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3aO08759 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3aO08759 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3aO08759 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms