Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20918J3QN17 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms