Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21969J3QJZ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms