Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21818J3KMS6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21818J3KMS6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms