Protein–RNA interactions for Protein: H3BKT1

Uncharacterized protein C19orf84 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BKT1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BKT1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3BKT1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3BKT1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3BKT1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3BKT1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3BKT1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3BKT1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3BKT1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3BKT1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BKT1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3BKT1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3BKT1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3BKT1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3BKT1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3BKT1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3BKT1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H3BKT1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H3BKT1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H3BKT1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H3BKT1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BKT1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BKT1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BKT1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BKT1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BKT1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BKT1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BKT1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BKT1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BKT1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BKT1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BKT1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BKT1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BKT1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BKT1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BKT1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BKT1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BKT1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BKT1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BKT1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BKT1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BKT1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BKT1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BKT1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BKT1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BKT1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BKT1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BKT1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BKT1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BKT1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BKT1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BKT1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BKT1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BKT1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BKT1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BKT1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BKT1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BKT1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms