Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b1G5E829 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2b1G5E829 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2b1G5E829 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.8 ms