Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nccrp1G3X9C2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nccrp1G3X9C2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nccrp1G3X9C2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms