Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim15G3UY57 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim15G3UY57 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms