Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r76F8VQ63 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r76F8VQ63 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms