Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2564F6Z9S8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2564F6Z9S8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms