Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3hdm1E9Q9Q2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3hdm1E9Q9Q2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3hdm1E9Q9Q2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms