Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Gm5407E9Q7Q1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5407E9Q7Q1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Gm5407E9Q7Q1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Gm5407E9Q7Q1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Gm5407E9Q7Q1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gm5407E9Q7Q1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Gm5407E9Q7Q1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Gm5407E9Q7Q1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Gm5407E9Q7Q1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5407E9Q7Q1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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