Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gcnt4E9Q649 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcnt4E9Q649 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Gcnt4E9Q649 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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Gcnt4E9Q649 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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Gcnt4E9Q649 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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Gcnt4E9Q649 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Gcnt4E9Q649 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcnt4E9Q649 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms