Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd1E9Q3H4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd1E9Q3H4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms