Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt90E9Q1Z0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt90E9Q1Z0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt90E9Q1Z0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms