Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3250E9Q1M3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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